Chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP là thành phần quan trọng trong chi phí khác của tổng mức đầu tư dự án. Việc xác định đúng định mức không chỉ đảm bảo tính minh bạch tài chính mà còn là điều kiện tiên quyết để cơ quan nhà nước phê duyệt quyết toán dự án hoàn thành. Bài viết này cung cấp thông tin chi tiết về cách tính, hệ số chiết khấu và những quy định mới nhất giúp chủ đầu tư thực hiện đúng quy trình pháp luật.
Quy định chung về chi phí kiểm toán và thẩm tra quyết toán
Trong hoạt động quản lý dự án đầu tư công, việc kiểm soát dòng vốn từ ngân sách nhà nước đòi hỏi sự khắt khe về mặt chứng từ và định mức. Chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP đã tạo ra hành lang pháp lý vững chắc cho việc này.
Mối liên hệ giữa Nghị định 99/2021/NĐ-CP và văn bản hướng dẫn
Nghị định 99/2021/NĐ-CP quy định về quản lý, thanh toán, quyết toán dự án sử dụng vốn đầu tư công, thay thế cho các quy định cũ nhằm phù hợp với Luật Đầu tư công. Để thực hiện chi tiết việc tính toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP, các chủ đầu tư thường tham chiếu cùng Thông tư 10/2020/TT-BTC của Bộ Tài chính. Đây là bộ đôi văn bản pháp lý quan trọng nhất mà bất kỳ kế toán dự án hay đơn vị tư vấn nào cũng phải nắm lòng.
Đối tượng bắt buộc thực hiện kiểm toán quyết toán dự án hoàn thành
Theo quy định hiện hành, các dự án sau đây phải thực hiện kiểm toán và thẩm tra quyết toán trước khi trình cấp có thẩm quyền phê duyệt:
- Dự án quan trọng quốc gia, dự án nhóm A sử dụng vốn đầu tư công.
- Các dự án thành phần, tiểu dự án vận hành độc lập có quy mô tương đương nhóm A.
- Dự án sử dụng vốn nhà nước ngoài đầu tư công theo quyết định của người có thẩm quyền.
Chi phí kiểm toán độc lập có bắt buộc không
Câu hỏi mà nhiều chủ đầu tư thắc mắc là liệu có nhất thiết phải thuê đơn vị bên ngoài hay không. Thực tế, việc xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP và thuê kiểm toán độc lập không chỉ là tuân thủ pháp lý mà còn mang lại lợi ích thực tế như:
-

Cách tính Chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP và thẩm tra quyết toán theo định mức Rà soát sai sót trong quá trình thi công và nghiệm tháo.
- Đảm bảo hồ sơ quyết toán sạch trước khi gửi lên cơ quan thẩm tra của Bộ hoặc Sở Tài chính.
- Rút ngắn thời gian phê duyệt quyết toán dự án hoàn thành nhờ báo cáo chuyên sâu.
Cách tính chi phí kiểm toán và thẩm tra quyết toán theo định mức
Xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP dựa trên quy mô vốn là bước đầu tiên để lập dự toán gói thầu tư vấn. Giá trị này thường được tính theo tỷ lệ phần trăm (%) nghịch biến với quy mô dự án.
Công thức xác định chi phí theo phân loại dự án
Mặc dù định mức chung áp dụng theo quy mô vốn, nhưng tính chất dự án (như xây lắp, thiết bị, quy hoạch) sẽ quyết định các hệ số đi kèm khi xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP. Dưới đây là bảng định mức chi phí chuẩn áp dụng cho các dự án đầu tư công:
| Tổng mức đầu tư (tỷ đồng) | Định mức phí kiểm toán (%) | Định mức phí thẩm tra (%) |
|---|---|---|
| Dưới 5 tỷ | 0,640 | 0,390 |
| 10 tỷ | 0,443 | 0,274 |
| 50 tỷ | 0,233 | 0,147 |
| 100 tỷ | 0,174 | 0,111 |
| 500 tỷ | 0,086 | 0,056 |
| 1.000 tỷ | 0,064 | 0,042 |
| Trên 10.000 tỷ | 0,022 | 0,015 |
Lưu ý rằng các mốc trên là căn cứ để tính toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cho các dự án nhóm A, B, C. Đối với các dự án có giá trị nằm giữa các mốc, các chuyên gia tại MAN – Master Accountant Network thường hỗ trợ khách hàng thực hiện tính nội suy để có con số chính xác nhất đưa vào dự toán.
Hướng dẫn phương pháp nội suy trong tính toán
Khi giá trị dự án không nằm đúng các mốc trong bảng, kế toán cần áp dụng công thức nội suy tuyến tính. Việc xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP theo phương pháp này đòi hỏi độ chính xác cao đến 3 chữ số thập phân sau dấu phẩy để tránh làm sai lệch giá trị gói thầu, gây khó khăn cho việc thanh quyết toán sau này.
Các hệ số điều chỉnh giảm chi phí kiểm toán và thẩm tra

Văn bản hướng dẫn chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cho phép áp dụng các hệ số giảm trong các trường hợp đặc thù nhằm tối ưu ngân sách nhà nước tùy theo tính chất kỹ thuật của từng dự án.
Dự án có tỷ trọng chi phí thiết bị lớn hoặc dự án quy hoạch
Đối với các dự án có tính chất mua sắm thiết bị là chủ yếu (chiếm từ 60% giá trị quyết toán trở lên) hoặc các dự án quy hoạch, bồi thường giải phóng mặt bằng, mức chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP thực tế sẽ ít hơn. Do đó:
- Chi phí kiểm toán độc lập = Định mức cơ bản x 70%.
- Chi phí thẩm tra quyết toán = Định mức cơ bản x 70%.
Định mức chi phí khi đã có báo cáo kiểm toán độc lập
Nếu chủ đầu tư đã thuê đơn vị chuyên nghiệp kiểm tra hồ sơ, cơ quan thẩm tra quyết toán của nhà nước sẽ được giảm nhẹ áp lực công việc. Khi đó, chi phí thẩm tra phê duyệt quyết toán của cơ quan quản lý sẽ chỉ được tính bằng 50% định mức thông thường sau khi đã tính toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP phù hợp.
Cách tính kết hợp cho các dự án đặc thù
Trong trường hợp dự án vừa có thiết bị chiếm trên 60%, vừa đã thực hiện kiểm toán độc lập, các hệ số tính toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP sẽ được nhân dồn theo quy tắc:
- Phí kiểm toán độc lập áp dụng hệ số 0,7.
- Phí thẩm tra quyết toán áp dụng hệ số 0,35 (tương đương 50% của 70%).
Mức phí kiểm toán tối thiểu và các quy định bổ sung
Nhà nước quy định mức sàn cho chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP để đảm bảo chất lượng dịch vụ kiểm toán độc lập và công tác thẩm tra.
Quy định về mức phí tối thiểu cho các gói thầu nhỏ
Theo quy định, mức chi phí kiểm toán độc lập tối thiểu cho một báo cáo quyết toán dự án hoàn thành là 1.000.000 đồng (chưa bao gồm VAT). Đối với công tác thẩm tra quyết toán của cơ quan nhà nước, mức tối thiểu là 500.000 đồng. Việc tính toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP dưới mức sàn này sẽ không hợp lệ khi trình duyệt quyết toán.
Các khoản thuế và chi phí phát sinh trong thực tế
Cần lưu ý một số điểm về tài chính khi triển khai chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cho gói thầu tư vấn:
- Chi phí kiểm toán thường đã bao gồm các khoản phụ phí đi lại nhưng chưa bao gồm thuế GTGT (VAT).
- Các khoản phí này được trích từ nguồn vốn đầu tư của dự án và nằm trong mục “Chi phí khác”.
- Chủ đầu tư thực hiện thanh toán dựa trên giá trị quyết toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cuối cùng được phê duyệt.
Phân biệt chi phí kiểm toán độc lập và chi phí thẩm tra quyết toán
Việc phân biệt rõ hai loại phí này giúp chủ đầu tư lập kế hoạch xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP chính xác ngay từ giai đoạn chuẩn bị đầu tư.
Bản chất pháp lý của hai loại phí
Kiểm toán độc lập là hoạt động mang tính chất tư vấn chuyên môn, trong khi thẩm tra quyết toán là hoạt động quản lý nhà nước. Kết quả của việc xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cho đơn vị tư vấn là sở hữu “Báo cáo kiểm toán” – căn cứ quan trọng để cơ quan tài chính thẩm tra và ra “Văn bản phê duyệt quyết toán”.
Tầm quan trọng của việc tách bạch khoản mục chi phí
Việc tách bạch giúp quản lý nguồn vốn minh bạch. Nếu không tách rõ dự toán chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP, khi thực hiện quyết toán dự án hoàn thành, chủ đầu tư dễ gặp khó khăn trong việc giải trình với các đoàn thanh tra, kiểm toán nhà nước về tính hợp lý của chi phí tư vấn.
Quy trình lựa chọn đơn vị kiểm toán quyết toán dự án hoàn thành
Lựa chọn đơn vị kiểm toán uy tín là yếu tố then chốt để hồ sơ chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP được thông qua nhanh chóng và chính xác.
Tiêu chuẩn năng lực và danh sách công bố
Chủ đầu tư chỉ được phép thuê các đơn vị đủ năng lực thực hiện chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP nằm trong danh sách của Bộ Tài chính. Các tiêu chí đánh giá bao gồm:
- Số lượng kiểm toán viên hành nghề (CPA) và năng lực đội ngũ chuyên gia.
- Kinh nghiệm kiểm toán các dự án đầu tư công quy mô lớn theo ngành nghề tương ứng.
- Khả năng phối hợp và giải trình chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP với các cơ quan thẩm tra địa phương.
Các bước triển khai dịch vụ kiểm toán tại MAN
Tại MAN – Master Accountant Network, quy trình được tối ưu hóa để đồng hành cùng chủ đầu tư trong việc xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP:
- Rà soát tính đầy đủ và hợp lệ của hệ thống chứng từ dự án.
- Thực hiện kiểm tra chi tiết giá trị xây lắp, thiết bị và xác định chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP tại văn phòng và hiện trường.
- Tư vấn xử lý các tồn đọng về hồ sơ pháp lý trước khi phát hành báo cáo chính thức.
- Hỗ trợ giải trình số liệu bảo vệ kết quả chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP trước cơ quan phê duyệt quyết toán thông qua trang liên hệ.
Giải đáp thắc mắc về chi phí kiểm toán theo Nghị định 99
Dưới đây là tổng hợp các câu hỏi thường gặp liên quan đến định mức chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP và quy trình quyết toán dự án sử dụng vốn ngân sách.
Chi phí kiểm toán độc lập tối thiểu theo Nghị định 99 là bao nhiêu?
Theo quy định, mức chi phí kiểm toán độc lập tối thiểu cho một báo cáo quyết toán dự án hoàn thành là 1.000.000 đồng (chưa VAT). Đối với công tác thẩm tra quyết toán của cơ quan quản lý nhà nước, mức phí tối thiểu được quy định là 500.000 đồng, áp dụng thống nhất cho các dự án đầu tư công.
Khi nào được giảm 30% chi phí kiểm toán dự án đầu tư công?
Chủ đầu tư được giảm 30% chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP khi dự án có tỷ trọng chi phí thiết bị chiếm từ 60% tổng giá trị quyết toán trở lên. Trường hợp này giúp tối ưu ngân sách đối với các dự án mua sắm đặc thù nhưng vẫn đảm bảo chất lượng kiểm toán.
Tại sao chi phí thẩm tra quyết toán giảm 50% định mức?
Khi dự án đã thực hiện kiểm toán độc lập, khối lượng công việc của cơ quan thẩm tra nhà nước được giảm bớt nhờ báo cáo chuyên sâu có sẵn. Vì vậy, định mức chi phí thẩm tra phê duyệt quyết toán sẽ chỉ tính bằng 50% so với định mức chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP cơ bản.
Chi phí kiểm toán theo Nghị định 99 có bao gồm thuế VAT chưa?
Định mức chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP quy định tại các văn bản pháp quy thường là mức phí dịch vụ chưa bao gồm thuế giá trị gia tăng (VAT). Chủ đầu tư cần lưu ý cộng thêm thuế suất VAT hiện hành khi lập dự toán gói thầu tư vấn kiểm toán để đảm bảo đủ kinh phí.
Dự án kéo dài thời gian có được tăng phí kiểm toán không?
Nếu tổng mức đầu tư không thay đổi, chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP vẫn giữ nguyên theo định mức tỷ lệ ban đầu dù thời gian kéo dài. Tuy nhiên, nếu việc kéo dài dẫn đến tăng tổng mức đầu tư hoặc phát sinh khối lượng, chủ đầu tư cần lập phụ lục điều chỉnh chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP.
Kết luận
Việc nắm vững cách tính chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP là yếu tố then chốt để quản lý hiệu quả nguồn vốn ngân sách nhà nước. Chủ đầu tư cần lưu ý các hệ số giảm định mức tùy theo tính chất dự án (như tỷ trọng thiết bị) để áp dụng chính xác. Sự đồng hành của MAN – Master Accountant Network với đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm sẽ giúp chủ đầu tư an tâm về tính chính xác của số liệu chi phí kiểm toán theo Nghị định 99/2021/NĐ-CP và đẩy nhanh tiến độ phê duyệt quyết toán cuối cùng.
Thông tin liên hệ MAN – Master Accountant Network
- Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
- Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
- Email: ma*@*****et.vn
Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.


